С 2003 года кафедра выпускает дипломированных специалистов по двум направлениям: «Организация перевозок и управление на железнодорожном транспорте» и «Организация перевозок и управление на автомобильном транспорте» с присвоением квалификации «Инженер путей сообщения» и «Инженер по организации и управлению на транспорте» соответственно.

С 2011 года кафедра перешла на двухуровневую систему высшего образования, которая включает бакалавриат и магистратуру. С 2015 преподавание на кафедре ведется в соответствии с Федеральными образовательными стандартами высшего образования (ФГОС ВО; ФГОС 3+).

История кафедры транспорта и логистики тесно связана с историей нашего университета, какое бы название он не носил – СМИ, СибГГМА, СибГИУ.

Она начинается в 1966 году, когда коллегией Министерства черной металлургии и Министерства высшего и среднего специального образования было принято решение об открытии в стране новой специальности «Промышленный транспорт».

Ректор Сибирского металлургического института (СМИ) Толстогузов Н. В. по поручению ученого совета института, выступил с предложением об открытии этой специальности в составе СМИ. Такая кафедра была первой и пока единственной восточнее Урала. Уже в 1967 году прошло первое зачисление абитуриентов. Первый набор студентов составил 50 человек.